Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snrpd1P62315 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snrpd1P62315 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snrpd1P62315 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snrpd1P62315 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snrpd1P62315 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snrpd1P62315 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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