Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Romo1P60603 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms