Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms