Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp4P59240 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms