Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpa1P57784 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms