Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NcstnP57716 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcstnP57716 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcstnP57716 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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