Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Usp25P57080 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp25P57080 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp25P57080 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp25P57080 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp25P57080 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp25P57080 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp25P57080 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp25P57080 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Usp25P57080 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Usp25P57080 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp25P57080 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Usp25P57080 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Usp25P57080 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp25P57080 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Usp25P57080 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Usp25P57080 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Usp25P57080 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp25P57080 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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