Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PctpP53808 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PctpP53808 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 394.1 ms