Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lbx1P52955 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lbx1P52955 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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