Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms