Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms