Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TspoP50637 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms