Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms