Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VdrP48281 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VdrP48281 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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