Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms