Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms