Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VhlP40338 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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VhlP40338 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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VhlP40338 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VhlP40338 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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