Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms