Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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