Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms