Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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