Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxraP28700 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxraP28700 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxraP28700 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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