Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hoxd10P28359 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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