Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa5P28312 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms