Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lef1P27782 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms