Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CftrP26361 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CftrP26361 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CftrP26361 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CftrP26361 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms