Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms