Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkchP23298 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkchP23298 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms