Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PparaP23204 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PparaP23204 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PparaP23204 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms