Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RarbP22605 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RarbP22605 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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RarbP22605 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RarbP22605 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RarbP22605 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RarbP22605 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RarbP22605 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RarbP22605 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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