Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Tap1P21958 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tap1P21958 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms