Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VimP20152 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VimP20152 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VimP20152 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VimP20152 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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