Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms