Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpraP18052 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PtpraP18052 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PtpraP18052 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PtpraP18052 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PtpraP18052 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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