Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcna1P16388 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcna1P16388 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcna1P16388 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcna1P16388 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcna1P16388 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcna1P16388 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcna1P16388 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Kcna1P16388 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Kcna1P16388 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcna1P16388 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms