Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CatspereP0DP43 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CatspereP0DP43 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms