Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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