Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
UbbP0CG49 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms