Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Itgb1P09055 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb1P09055 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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