Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Me1P06801 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Me1P06801 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Me1P06801 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms