Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Eb1P04230 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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H2-Eb1P04230 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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