Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms