Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CopeO89079 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CopeO89079 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CopeO89079 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CopeO89079 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CopeO89079 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CopeO89079 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CopeO89079 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CopeO89079 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CopeO89079 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CopeO89079 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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