Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ComtO88587 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ComtO88587 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ComtO88587 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ComtO88587 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ComtO88587 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ComtO88587 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms