Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms