Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms