Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms