Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FxnO35943 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FxnO35943 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FxnO35943 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FxnO35943 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms