Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited2O35740 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms