Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc1a6O35544 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc1a6O35544 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc1a6O35544 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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